En los últimos cuatro años, y gracias a una acción cofinanciada por la política de cohesión de la Unión Europea (UE) a través del Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER), la Fundación Fisabio ha destinado más de 9 millones de euros a la mejora de sus infraestructuras en las áreas de Secuenciación y Bioinformática, Deterioro Cognitivo, Enfermedades Raras, Laboratorios de Seguridad Biológica de Nivel 2+ y Nivel 3, Seguridad Alimentaria y la Red Valenciana de Biobancos.
Esta inversión ha resultado ser especialmente útil cuando el coronavirus comenzó a afectar a España. Desde el inicio de la pandemia, el Servicio de Secuenciación y Bioinformática de la Fundación Fisabio ha secuenciado cerca de 4.000 muestras del virus del SARS-CoV-2, lo que representa el 70% de las secuencias de virus obtenidas en España. Esta cifra de genomas secuenciados sitúa a España como el cuarto país del mundo en número de secuencias aportadas a la red GISAID. Esta secuenciación es clave para el conocimiento de la dispersión del virus y el desarrollo de nuevos medicamentos, tratamientos y vacunas.
«Sin esta importante inversión en infraestructuras, la Fundación Fisabio no hubiera podido poner en marcha con tanta rapidez un laboratorio de diagnóstico de emergencia y de vigilancia del virus SARS-CoV-2 que nos ha permitido ofrecer una respuesta efectiva ante la pandemia. Este papel fundamental en el seguimiento de la COVID-19 también será alcanzable para la vigilancia de otros brotes en la Comunitat Valenciana en un futuro», destaca José Antonio Manrique, director gerente de Fisabio.
El proyecto de secuenciación del virus, liderado por el investigador del IBV-CSIC, Iñaki Comas, se centra en la obtención de secuencias completas del genoma del SARS-CoV-2 y en la recogida de datos epidemiológicos del virus para establecer las rutas detalladas de transmisión en diferentes áreas geográficas y comprender mejor la dinámica del virus.
Este proyecto, que co-lidera Fernando González, responsable de la Unidad Mixta de Investigación en Infección y Salud Pública de la Fundación FISABIO-Universitat de València y del Laboratorio en Red de Vigilancia de Resistencias a Antimicrobianos de la Comunitat Valenciana, también financiado con fondos de la UE, evalúa el impacto de las diferentes medidas adoptadas ante la pandemia, analizando el número de infecciones no diagnosticadas, con el objetivo de proporcionar información útil para la vigilancia en los próximos meses.
En el estudio se obtendrán y analizarán unas 15.000 secuencias completas del genoma del virus, procedentes de más de 30 laboratorios clínicos de Microbiología de toda España.
Una gran parte de estas secuencias serán obtenidas por el Servicio de Secuenciación y Bioinformática de Fisabio, que coordinan Llúcia Martínez Priego y Giuseppe D’Auria. Este servicio ha aumentado considerablemente sus capacidades máximas con la financiación recibida por los fondos de Política de cohesión de la UE. En particular, la adquisición de un secuenciador Illumina NextSeq500 ha permitido pasar de secuenciar 80 genomas bacterianos por semana a 400.
En concreto, en el caso de la secuenciación de SARS-CoV2, actualmente el Servicio de Secuenciación dispone de una capacidad máxima de 1.376 muestras a la semana. Con anterioridad a la financiación europea, esta capacidad era de 192.
